Several  epidemiological  studies  have  linked  flavonols  with  decreased  risk  of  cardiovascular  disease  (CVD).  However,  some  heterogeneity  in  the  individual  physiological  responses to the consumption of these compounds has been identified. This meta-analysis aimed to  study the effect of flavonol supplementation on biomarkers of CVD risk such as, blood lipids, blood  pressure and plasma glucose, as well as factors affecting their inter-individual variability. Data from  18 human randomized controlled trials were pooled and the effect was estimated using fixed or  random effects meta-analysis model and reported as difference in means (DM). Variability in the  response of blood lipids to supplementation with flavonols was assessed by stratifying various  population subgroups: age, sex, country, and health status. Results showed significant reductions  in total cholesterol (DM = -0.10 mmol/L; 95% CI: -0.20, -0.01), LDL cholesterol (DM = -0.14 mmol/L;  Nutrients 2017, 9, 117  2 of 21  95% CI: -0.21, 0.07), and triacylglycerol (DM = -0.10 mmol/L; 95% CI: -0.18, 0.03), and a significant  increase in HDL cholesterol (DM = 0.05 mmol/L; 95% CI: 0.02, 0.07). A significant reduction was also  observed in fasting plasma glucose (DM = -0.18 mmol/L; 95%CI: -0.29, -0.08), and in blood pressure  (SBP: DM = -4.84 mmHg; 95% CI: -5.64, -4.04; DBP: DM = -3.32 mmHg; 95% CI: -4.09, -2.55).  Subgroup analysis showed a more pronounced effect of flavonol intake in participants from Asian  countries and in participants with diagnosed disease or dyslipidemia, compared to healthy and  normal baseline values. In conclusion, flavonol consumption improved biomarkers of CVD risk,  however, country of origin and health status may influence the effect of flavonol intake on blood  lipid levels.