En este trabajo nos centramos en las problemáticas educativas que enfrentaron las comunidades indígenas frente a las medidas establecidas por la pandemia de COVID-19. Para ello se caracteriza en un primer momento la modalidad Educación Intercultural Bilingüe con la finalidad de poner en evidencia los problemas que ya presentaba la educación para pueblos originarios antes de la pandemia. Luego, se describe la situación educativa durante las medidas impulsadas por los gobiernos para hacer frente al COVID-19 con el objetivo de señalar cómo este contexto particular agravó los problemas ya existentes.